Désolé pour le double post mais pour ceux qui sont dans la même situation et que ca peut aider :
1. J'ai ajouté dans les applis au démarrage une commande perso "compiz". Pourquoi celle-ci au lieu de "compiz --replace" plus souvent utilisé : car la commande "compiz" seule permet de lancer le gestionnaire dans la session pantheon-compiz, et en même temps ne se déclenche pas dans la session sous Pantheon (enlever le --replace ne lui permet pas de se lancer si un autre gestionnaire est déja lancé me semble-t-il, du moins par rapport à gala).
2. Concernant les thèmes de fenêtre différents selon les applis, il semble que les applis systèmes (geary, parmètres systèmes, midori) ont bienle thème élémentary alors que mozilla ou d'autres applis ont un thème élémentary pour metacity. Il semble que les applis n'ayant pas le thème "identique" utilise le thème Metacity (seules leurs fenêtres changent quand on choisit le thème Metacity dans tweaks), alors que si je veux changer le thème des fenêtres aux bordures correctes, c'est le thème gtk3 que je dois modifier. Sans doute un problème de comptibilité gtk 3.
3. Un dernier bug est que sous compiz je ne peux plus profiter de pantheon-notify. Y'a t-il moyen de le faire fonctionner ou devrais-je plutôt installer notify-osd avec compiz ?
Je tiens à ajouter que toutes ces questions sur Compiz dans elementary n'enlève pas l'interêt que je porte à Gala qui est assez performant, mais qui pour mon utilisation manque d'un peu plus de configuration et d'options. D'ou ma volonté de créer 2 sessions bien distinctes sans que l'une ne vienne mettre le bazar dans l'autre avec certains programmes, afin de pouvoir tester l'évolution de Gala.
Si certains ont des idées , je suis preneur.